Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms