Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt27Q9Z320 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt27Q9Z320 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms