Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms