Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vamp5Q9Z2P8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms