Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd1Q9Z2E2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd1Q9Z2E2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms