Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs4Q9Z1T2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms