Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf394Q9Z1D9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms