Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms