Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sumo3Q9Z172 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sumo3Q9Z172 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms