Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl8Q9Z121 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl8Q9Z121 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl8Q9Z121 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl8Q9Z121 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl8Q9Z121 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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