Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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