Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn3Q9Z0G9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn3Q9Z0G9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms