Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib1Q9Z0F4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms