Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp2Q9Z0E6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms