Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms