Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx1Q9WV80 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms