Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Opn3Q9WUK7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Opn3Q9WUK7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Opn3Q9WUK7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Opn3Q9WUK7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Opn3Q9WUK7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Opn3Q9WUK7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Opn3Q9WUK7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Opn3Q9WUK7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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