Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pus1Q9WU56 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pus1Q9WU56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms