Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lemd3Q9WU40 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms