Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms