Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sorbs3Q9R1Z8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms