Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms