Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gpc6Q9R087 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc6Q9R087 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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