Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms