Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms