Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ67

Ppm1d, Protein phosphatase 1D, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1dQ9QZ67 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppm1dQ9QZ67 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppm1dQ9QZ67 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms