Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms