Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY24

Zbp1, Z-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbp1Q9QY24 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbp1Q9QY24 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbp1Q9QY24 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms