Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Opn4Q9QXZ9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Opn4Q9QXZ9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Opn4Q9QXZ9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn4Q9QXZ9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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