Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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