Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ChmQ9QXG2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms