Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim44Q9QXA7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms