Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms