Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms