Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp3a41aQ9JMA7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms