Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SrfQ9JM73 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrfQ9JM73 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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