Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thsd1Q9JM61 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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