Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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