Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg3Q9JL95 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prg3Q9JL95 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms