Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gde1Q9JL56 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gde1Q9JL56 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gde1Q9JL56 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gde1Q9JL56 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms