Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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