Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms