Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms