Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Uchl3Q9JKB1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Uchl3Q9JKB1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Uchl3Q9JKB1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Uchl3Q9JKB1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Uchl3Q9JKB1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Uchl3Q9JKB1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms