Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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