Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ccdc86Q9JJ89 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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