Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms