Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms