Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl28Q9JIL2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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