Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htr3bQ9JHJ5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htr3bQ9JHJ5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms